Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms