Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms