Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms