Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTDSPL2Q05D32 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms