Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms