Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 608.1 ms