Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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