Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms