Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms