Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms