Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms