Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB25P57735 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB25P57735 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB25P57735 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms