Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms