Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN15P56746 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms