Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH15P55291 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH15P55291 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms