Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms