Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSEN1P49768 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms