Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TTPAP49638 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTPAP49638 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TTPAP49638 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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TTPAP49638 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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TTPAP49638 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTPAP49638 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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