Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA4P48169 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms