Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA4P48058 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms