Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGER3P43115 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms