Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A3P43003 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms