Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPOP42166 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPOP42166 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPOP42166 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms