Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAP3K8P41279 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms