Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms