Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDFT1P37268 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms