Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms