Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms