Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP1P30622 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms