Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PPIFP30405 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PPIFP30405 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms