Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD1P28340 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms