Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HTR2AP28223 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms