Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRZ1P23471 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms