Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms