Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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