Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD247P20963 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD247P20963 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms