Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB3BP20337 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB3BP20337 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB3BP20337 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms