Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms