Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PDE6GP18545 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PDE6GP18545 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PDE6GP18545 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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