Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARF4P18085 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARF4P18085 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF4P18085 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARF4P18085 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARF4P18085 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF4P18085 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms