Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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