Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA1P14867 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA1P14867 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms