Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRF1P14222 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms