Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL2P13500 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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