Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GP1BBP13224 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms