Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms