Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEFHP12036 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEFHP12036 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms