Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODC1P11926 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODC1P11926 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODC1P11926 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms