Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DMDP11532 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DMDP11532 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DMDP11532 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DMDP11532 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DMDP11532 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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