Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GLI4P10075 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms